The tumour suppressor RBM5 activates the helicase DHX15 to regulate splicing
本論文は、腫瘍抑制因子 RBM5 がスプライソソームに結合して DHX15 ヘリカーゼを活性化しつつ物理的に進行を阻害する「二重機能」を有し、アポトーシス関連の選択的スプライシングを制御することでがん抑制に寄与することを、クライオ電子顕微鏡構造解析と機能アッセイにより明らかにしたものである。
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molecular biology
366 件の論文
mRNA stability in response to m6A placement is linked to cell identity in planarians
プランarians において、m6A 修飾は細胞の種類に依存して mRNA の安定性を相反する方向に制御し、細胞のアイデンティティ形成に重要な役割を果たしていることが、高信頼度の m6A サイトアトラスの作成と機能解析を通じて明らかにされました。
Single-cell resolution uncovers cell type-specific dysregulation in Parkin-deficient neuron-microglia co-cultures
本研究は、iPSC 由来のドパミン作動性ニューロンとミクログリアの共培養系に単核 RNA シーケンシングを適用することで、パルキン欠損がニューロンにおけるミトファジーやドパミン恒常性の障害、ミクログリアにおけるカルシウム恒常性や炎症シグナルの異常という、細胞タイプ固有の分子メカニズムを解明したものである。
Functional divergence of Capicua isoforms explains differential tissue vulnerability in neurological disease
Capicua（CIC）の長型（CIC-L）と短型（CIC-S）がそれぞれ異なるパラログ（Ataxin-1 および Ataxin-1-like）と優先的に相互作用し、異なる表現型を示すことが明らかになったことで、神経変性疾患における組織特異的な脆弱性のメカニズムが解明されました。
From Adipose to Limbus: Deciphering the Paracrine Effects of MSC Secretomes on Oxidative Stress-Induced RPE Dysfunction
本論文は、酸化ストレスにより損傷した網膜色素上皮細胞に対し、脂肪由来および角膜縁帯由来間葉系幹細胞の分泌体が、細胞生存率の向上、抗炎症・抗アポトーシス作用、および異常血管新生の抑制を通じて多角的な修復効果を示すことを明らかにし、これらが網膜疾患に対する細胞フリー療法の有望な候補であることを報告している。
Cryo-EM structures of the CDK11-cyclin L-SAP30BP complex reveal mechanisms of CDK11 regulation
本研究は、クライオ電子顕微鏡を用いて CDK11-サイクリン L-SAP30BP 複合体の高分解能構造を解明し、SAP30BP による複合体の安定化機構、CDK11 の自己調節メカニズム、および臨床用阻害剤 OTS964 の選択性の分子基盤を明らかにしたものである。
Local clocks within human tissues reveal widespread 24-hour rhythms in gene expression
本論文は、CHIRAL を用いた組織特異的な局所位相の推定により、ヒトの脳を含む全身組織で広範な 24 時間リズムが検出され、特にアルツハイマー病やパーキンソン病などの神経変性疾患関連遺伝子の多くが日内リズムを示すことを明らかにし、新たな疾患メカニズムの解明やクロノセラピーの機会を提供するものです。
Effects of protein interface mutations on protein quality and affinity
本研究は、単一ドメイン抗体と抗原の結合における「タンパク質相互作用」と「タンパク質品質（安定性や発現など）」を大規模な変異スクリーニングデータを用いて分離する実験・解析フレームワークを提示し、既存の計算モデルの性能が主にタンパク質品質の影響を反映していることを明らかにすることで、次世代の親和性予測モデルの構築にタンパク質品質の考慮が不可欠であることを示唆しています。
Copper Import via CTR1 Supports the β3-Adrenergic Thermogenic Program
この論文は、銅イオンの取り込みを担うCTR1がβ3-アドレナリン受容体刺激によりアップレギュレーションされ、褐色脂肪組織における銅の蓄積を介してミトコンドリア酸化や脂質分解を促進することで適応性熱産生を維持する重要なメカニズムであることを明らかにしています。
An upstream open reading frame represses translation of the neuronal potassium channel KCNQ2
本研究は、新生児発症てんかんと関連する神経カリウムチャネル KCNQ2 の翻訳を抑制する上流オープンリーディングフレーム（uORF）を同定し、その開始コドンの変異や塩基編集によってタンパク質翻訳を促進できることを示すことで、疾患リスク評価と治療戦略の新たな可能性を提示しました。
FUS and TAF15 safeguard the critical functions of the ribonucleoprotein network formed by EWSR1 and newly synthesized RNA
本論文は、FET 蛋白ファミリー（FUS、EWSR1、TAF15）が新生 RNA とリボヌクレオタンパク質ネットワークを形成し、EWSR1 の欠損時に FUS と TAF15 が補償的に再編成されることで、新生 RNA レベルの恒常性維持に重要な機能的冗長性を持つことをナノスケールイメージングにより明らかにしたものである。
Muscleblind-like proteins dimerize by forming disulfide bonds to regulate alternative splicing and pathogenic RNA foci formation
本論文は、筋ジストロフィー1 型において MBNL1 および MBNL2 がジスルフィド結合を介して二量体を形成し、核内での機能や RNA フォーシの構造維持、ならびに選択的スプライシングの調節に重要な役割を果たしていることを明らかにしたものである。
Cleavage specificity of E. coli YicC endoribonuclease
本論文は、E. coli YicC エンドリボヌクレアーゼが、二次構造を持つ比較的小さな RNA または大きな RNA から生じる断片を好む基質特異性を持つことを示し、その天然基質が大型 RNA ではなく小 RNA である可能性を提案している。
Genome-wide DNA supercoiling arises from transcription and SMC activity and mediates transcriptional negative feedback
この論文は、ヒト細胞において転写による正の超らせんの非対称な緩和と SMC コンプレックスの活動がゲノム全体の DNA 超らせんを形成し、その結果として生じる負の超らせんの蓄積が局所的な転写を抑制する負のフィードバック機構を介して遺伝子発現を調節することを明らかにしました。
Persistent Low-Level Infections of Elephant Endotheliotropic Herpesvirus and Elephant Gammaherpesvus in Skin Nodules and Saliva from Wild and Zoo African Elephants
この研究は、アフリカゾウ（サバンナおよび森林）とアジアゾウの野生個体および飼育個体から採取した皮膚結節、唾液、組織サンプルを対象に、7 年間にわたって実施された PCR 解析により、既知の象内皮嗜性ヘルペスウイルス（EEHV）および象ガンマヘルペスウイルス（EGHV）の多様な遺伝子型を確認するとともに、EEHV3C-H や EEHV7B などの新規亜型を発見し、象ウイルス学コミュニティに重要な遺伝子ライブラリを提供したことを報告しています。
Extended nuclear glycosylation regulates RNA processing
本研究は、分泌経路由来の延長型 O 型グリカンが能動的な小胞輸送により核内へ運ばれ、RNA 結合タンパク質のグリコシル化を通じて tRNA 処理を含む RNA 処理を調節することを明らかにし、細胞内でのグリコシル化の役割に関する従来のパラダイムを覆す発見です。
Low Transcriptional Complexity Cells Represent a Conserved, Aging-Relevant Maintenance State Overlooked by Single-Cell Transcriptomics
本研究は、従来のシングルセル解析で品質管理基準により除外されがちだった「低転写複雑性」の細胞状態が、老化や組織維持に関わる生物学的に重要な保存された状態であり、単細胞ゲノミクスにおける転写の希薄さの解釈に新たな視点をもたらすことを明らかにしました。
S. cerevisiae Cwc15p Tunes the Spliceosome Active Site for 5' Splice Site Cleavage
本論文は、酵母の必須ではないが高度に保存されたスプライソソーム因子 Cwc15p が、5'スプライス部位切断における活性部位の安定化と構造遷移の調節を通じて、非最適条件下でのスプライシング効率や選択性に関与していることを明らかにしたものである。
Structural Insights into Bromodomain-Containing Complexes from Trypanosoma cruzi Revealed by Proximity Labeling and Stoichiometric Space Exploration
本論文は、TurboID による近接ラベリングと新規な化学量論的探索手法を組み合わせることで、キナズス症の原因生物トリパノソーマ・クルージにおけるブロモドメイン含有複合体（CRKT および NuA4）の構成と立体構造を解明し、合理的な創薬への新たな道を開いたことを報告しています。
Expression landscape of the genetic hearing loss protein whirlin across human tissues and cell types.
この論文は、ヒトタンパク質アトラスのデータを活用して、遺伝性難聴関連タンパク質「whirlin」のヒト全身の組織および細胞種における発現パターンを初めて包括的に解明し、聴覚や視覚以外の役割に関する研究のための重要な基盤を提供したものである。